天启元年春天，努尔哈赤率大军攻克沈阳城，随后率领主力部队攻打辽阳，在沈阳只留下了少量驻守部队。

林丹汗闻讯后命令蒙古左翼三万户大臣率领两千名骑兵赶往沈阳，营救被关在城中的齐赛诺延。蒙古骑兵在沈阳城下与后金守军展开激战，但再度败北。

当年秋天，内喀尔喀部bp交出一万头牲畜，赎回了齐赛诺延。

在天启元年的这次战争中，努尔哈赤攻克了辽东第一重镇辽阳城，随后把都城从萨尔浒迁到这里，但是由于辽阳城面积太大、汉人太多，因此下令在太子河东边修建东京城，作为新国都。

天启二年年正月，努尔哈赤西渡辽河，占领了广宁城，到天启四年年时，已经几乎扫清了辽东的全部明朝势力，定都于沈阳，建立了巩固的nn。接下来，努尔哈赤把目光投向了察哈尔。

为了削弱察哈尔的力量，努尔哈赤先是对内喀尔喀和科尔沁进行拉拢。

努尔哈赤的次子代善在万历四十二年迎娶科尔沁扎鲁特部钟嫩台吉之女，努尔哈赤第四子皇太极先后迎娶科尔沁部莽古思台吉之女和寨桑台吉之女，第五子莽古尔泰迎娶扎鲁特部内齐汗之女，第十子德格类迎娶了扎鲁特部额尔济格台吉之女。

万历四十三年，努尔哈赤又纳科尔沁部孔果尔台吉之女为妃万历四十五年，内喀尔喀的恩格德尔台吉又迎娶了舒尔哈齐的女儿爱新觉罗家族与科尔沁蒙古之间的频繁通婚，使得后金减少了来自西北方向的压力，得以集中力量对付察哈尔。

万历四十七年铁岭战役之后，后金使臣与内喀尔喀五部的部分台吉在小兴安岭的色特尔黑会盟，宰杀白马黑牛，彼此修好通婚。这是努尔哈赤削弱林丹汗力量的又一着，林丹汗严厉谴责管理左翼三万户的大臣锡尔呼纳克杜凌管束不得力，甚至怀疑他也与后金暗通款曲，锡尔呼纳克杜凌不肯忍受如此羞辱，于是在天启二年年干脆带着三千多户蒙古人投奔了努尔哈赤。

信奉黄教的外喀尔喀三汗，尤其是n汗、以及漠南蒙古其余比较大的各部，也在林丹汗皈依红教后与他貌合神离，乌珠穆沁、苏尼特、浩齐特、阿巴噶等部纷纷出现了领主带着属民投奔漠北喀尔喀的事件。

天启四年年努尔哈赤去世，其第四子皇太极继承后金大汗之位，随即加快了征讨林丹汗的步伐。

天启五年春天，皇太极以使臣被杀为理由，任命其弟多尔衮和多铎为先锋，亲自率领精锐部队征讨察哈尔。作为报复，林丹汗出兵西辽河，攻打与后金互通使者的喀喇沁部，结果令土默特、鄂尔多斯、永绍不和阿苏特等部深感唇亡齿寒之危，这些部落的一些台吉纷纷起兵攻打林丹汗的部队。

这次战役之后，喀喇沁部也举行白马乌牛之誓，归顺了皇太极。

崇祯元年夏末，皇太极利用秋高马肥的机会发动第二次察哈尔战役，内喀尔喀、科尔沁和喀喇沁的首领纷纷起兵响应，攻入察哈尔放牧之地，掠夺了许多牲畜，胜利而归。在这次战役中，阿鲁科尔沁和阿苏特部也归顺了后金。

显然，对于这些部落来说，在一个勃兴的满蒙联盟中接受臣属的地位，可以分得一些好处，这比直接与满族争夺对中国的统治要容易些。

崇祯五年年春天，皇太极决定对察哈尔发动总攻，传令归顺后金的蒙古各部迅速率兵前来会师。