大军撤回后,朝臣议论认为军队并未与敌人交锋,所以不进行封赏。
但是朝臣们听说孙坚曾列举董卓的三条罪状,多次劝谏张温诛杀董卓,无不赞叹,于是朝廷任命孙坚为议郎。
中平四年(公元187年)十月,长沙郡贼首区星自称将军,聚众万余人叛乱,四处攻打城池。
朝廷任命孙坚为长沙郡太守,孙坚到任后,确定平叛的战略计策,亲自率领将士经过一个月的讨伐,
击溃叛军。又有周朝在零陵郡起兵反叛,郭石在桂阳郡起兵反叛,与区星互相呼应。孙坚于是率部跨过郡县的边界前往征讨,
平定叛乱,让长沙、零陵、桂阳三个郡县的秩序恢复平静。朝廷追评孙坚前后的功劳,封他为乌程侯。
汉灵帝驾崩,董卓专权擅势,在京城任意横行。汉献帝初平元年(公元190年),后将军袁术、
冀州牧韩馥、渤海太守袁绍、陈留太守张邈、奋武将军曹操等人纷纷举义兵讨伐董卓,推举袁绍为盟主,
孙坚也在长沙举兵响应。荆州刺史王叡素来对孙坚无礼,孙坚带兵经过时,把王叡
孙坚率部抵达南阳(今河南省南阳市),他部下已经有几万人马。南阳郡太守张咨听说大军到达后,
若无其事并不重视。孙坚就以牛和酒作为礼物送给张咨,次日张咨也带着礼物来回访。孙坚摆酒招待,
酒至半酣,长沙主簿进来告诉孙坚,此前曾发公文给南阳郡让他们准备迎接大军,现在道路没有修好,
军粮物资也没有备办,建议逮捕南阳郡主簿问罪。张咨听了很恐惧,就要起身离开,但周围都是看守的士兵,
无法出去。不一会儿,主簿又来报告,认为南阳郡太守故意贻误军情,论罪当诛。孙坚于是立即将张咨拖到军营大门斩首,南阳郡内官民震恐,不敢再怠慢孙坚的要求。
孙坚率军抵达鲁阳(今河南省鲁山县),与后将军袁术相见。袁术上表朝廷,推举孙坚为破虏将军,兼任豫州刺史。
孙坚就在鲁阳城里驻扎,训练士卒。等到进军讨伐董卓的时候,孙坚派遣部下长史公仇称,
带着豫州从事前往豫州催运军粮。孙坚在鲁阳城的东门外搭起帐篷,设宴为公仇称送行,属下官员都前来赴会。
不料董卓派遣部将胡轸、吕布率领步骑数万人前来进攻,轻骑兵先头部队率先抵达鲁阳城下。
孙坚得知后仍然斟酒说笑,同时下令将士整顿队伍,不准妄自行动。眼看敌人后方骑兵赶到,
敌人越聚越多,孙坚这才结束宴会,让仪仗队相继进城。孙坚对左右部下表示,之前不立即起身进城的原因,
是怕士兵相互踩踏,引起混乱。董卓的士兵看到孙坚的军队十分整齐,不敢攻城,只得撤退。
孙坚率军转移到梁县东面驻扎,结果遭到董卓军队的大举进攻,孙坚战败,只带了数十名骑兵突围而出。
孙坚平时细化戴红色毡帽,于是脱下帽子让心腹将领祖茂戴上。董卓的骑兵争相追赶祖茂,
孙坚这才从小路得以逃脱。祖茂被追得走投无路,只好下马将红毡帽挂在坟地中间一根烧断的木柱上,
然后躲进草丛。董卓的骑兵看到后,把木柱包围了好几层,走进一看才发现是一截木柱,于是掉头离开
孙坚逃脱之后,又重新收拢散兵,聚合军队,在阳人(今河南省临汝西)与敌军展开激战,击败敌人,
斩杀董卓的部将华雄等人。这时,有人在袁术面前说孙坚的坏话,离间两人,袁术怀疑孙坚,不给他运送军粮。
阳人距离袁术的驻地鲁阳(今河南省鲁山县)有一百多里,孙坚连夜骑马赶去见袁术,在地上比划着说明情况。
孙坚抱怨,自己和董卓没有仇恨,冲锋陷阵不畏艰险,反而被袁术怀疑;袁术听了他的话,局促不安,马上调发军粮,孙坚随即回到驻地。
董卓畏惧孙坚的勇猛,于是派部将李傕等人前来求和,让孙坚列举亲属子弟中可以担任州刺史、郡太守的人,
答应上表朝廷,全都任用为官。孙坚认为董卓违背天意、大逆不道,坚决拒绝和解。孙坚于是挥兵推进到大谷关,
距洛阳只有九十里。董卓只好下令把都城向西迁入函谷关,纵火焚烧洛阳城。孙坚攻占洛阳,
修复汉朝先帝的陵墓,填平被董卓发掘的墓穴坑洞。做完这些事,孙坚才引兵退回,驻扎在鲁阳(今河南省鲁山县)。
初平三年(公元192年),袁术派孙坚率军征伐荆州,进攻荆州牧刘表。刘表命部将黄祖率军在樊城和邓县之间迎战。
孙坚击溃黄祖的军队,乘胜追击渡过汉水,包围襄阳城。孙坚追击黄祖,独自骑马来到岘山(今湖北襄阳市襄城区以南),
结果被黄祖的士兵用箭射死。长沙人桓阶早年曾受孙坚举荐为孝廉,他冒险拜见刘表,请求为孙坚办理丧事,刘表钦佩其义举并同意。
孙坚死后,他哥哥孙羌的儿子孙贲统率其部下依附于袁术,袁术又上表推举孙贲为豫州刺史。
后来,孙坚的长子孙策脱离袁术,率军平定江东;孙策死后,孙坚的次子孙权建立孙吴政权并称帝,追谥孙坚为武烈皇帝,庙号始祖,并将其葬于高陵。
时人对孙坚的评价褒贬不一。汉献帝刘协称赞孙坚平叛有功;
东汉权臣董卓认为孙坚善于用人;孙吴将领朱治评价孙坚举义兵讨伐董卓,可谓“声冠中夏,义士壮之”;
晋朝史家陈寿评价孙坚“勇挚刚毅”,曾劝谏张温诛杀董卓,“有忠壮之烈”;
汉末军阀公孙瓒、晋朝学者陆机都认为孙坚在汉末乱世之中,仍然保持忠勇,为朝廷举兵平定叛乱、讨伐董卓、安定宗庙,算得上是忠臣。
但魏明帝曹叡认为孙坚“劫略州郡,遂成群凶”,后来孙策、孙权割据江东,心怀叛逆;
魏晋时期大臣华谭认为,孙坚虽然受到时人称赞,讨伐董卓有功,但在攻打襄阳时疏忽大意,最终被敌人射杀。
南朝宋史学家裴松之评价:孙坚在举义兵讨伐董卓的将领中最有忠烈的名声,如果他得到汉朝的传国玉玺