双方道馆的手下也拿出宝可梦开战。因为马联盟的鉴定员就要来黑暗市，所以这是最后的战斗。

“皮卡丘，十万伏特！喷火龙，喷射火焰！”正在他们打的难分难解的时候小智带着他的宝可梦杀了出来，挡在面前。

“你是谁？×2”

“来管你们的人。”小智说着就叫其它的宝可梦对付他们的手下，皮卡丘和喷火龙对付电击兽和飞天螳螂。

“皮卡丘对飞天螳螂使用十万伏特！喷火龙对电击兽使用喷射火焰！”飞天螳螂被皮卡丘的十万伏特电成了焦炭；电击兽也被喷火龙的喷射火焰烧成焦炭；而他们的手下有的被袋兽母子和妙蛙种子的藤鞭甩飞；被杰尼龟的水枪和比比鸟的燕返击倒。

“可恶！×2”亚斯和卡兹收回飞天螳螂和电击兽，握住彼此的手，亚斯道：“这个情况先暂时停战吧。”；

“没错直到把他们痛打一顿为止。”卡兹同意了亚斯的意见。

“兄弟们，啊！！×2”宝可梦虽然败了，但人还可以打，于是他们叫手下，手下们一口气向小智冲了来。

小智的宝可梦们刚想出手，小智做了个退下的手势要它们退下，说道：“人类与人类的争斗还是有人类自己决绝。”

于是小智一人冲去单挑众人，顿时全场硝烟四起，一阵烟雾过后一个人影从烟雾里出现，向亚斯和卡兹走了过去，当亚斯和卡兹看清人影的时候惊呆了，“那个人就是小智，烟雾散去他们的手下‘全军覆没’瘫倒在地”。

一个手下用尽最后的力气说道：“馆主……快跑……这小子绝对不是人……呃…………”

宝可梦世界的人体质都很强，小智一向被称为“超级真新人”是众所周知的，而这个小智可以说是“究级真新人”。

“好了以后你们两个和平相处吧。”小智双手叉腰说道。

“开什么玩笑。×2”两位馆主依然不服气，捡起棍子向小智逼近。

“等一下。”这时，出现了一个带着帽子，穿风衣，带着口罩和墨镜的人。

“什么？”“你是什么东西啊？”亚斯和卡兹问道。

“我是宝可梦联盟派过来的正义的鉴定员。”说着鉴定员扔出了精灵球，跳出了只带着护士帽的吉利蛋。

“难道你是……”

“没错，我的真正身份是…乔伊。”乔伊小姐真实了身份，后对亚斯和卡兹严厉的训斥道：“只会利用宝可梦来打架的人所开的道馆是绝对不可能获得宝可梦联盟正式承认的。”

“怎么会这样？”“可不可以请你网开一面呀。”两人底下头沮丧的说道。

“除非你们有重新再来的决心怎么样？”乔伊笑着说道。

“当然有了。”“该怎么做比较好，请告诉我们好吗？”两人恳求道。

“与其问我，你们倒不如问更适合的人。”乔伊说着向他们介绍了站在后面的人“小智”。

“我？”小智指着自己好像还不清楚乔伊的话。

“老师，请你给我们指点吧。×2”小智还没反应过来亚斯和卡兹就跪在了他面前。

于是小智吩咐他们复原黑暗市，然后像个老师一样给他们讲了很多，有他的训练家三原则还有“不可以把宝可梦用在人类与人类之间的争斗中；训练家的责任不是要锻炼出最强的宝可梦而是要构建人类与宝可梦的和谐桥梁，让更多的人喜欢宝可梦、爱护宝可梦、善待宝可梦。”

在小智的指点下，两位道馆馆主改邪归正，重建城镇，使镇的居民不再讨厌宝可梦训练家，城镇也恢复了和平。

皮卡丘也成了那三个小鬼头的小老师，给他们留下了他的小手掌印做签名。

离开了黑暗市，小智和皮卡丘继续前进。